El problema de Dios para Zubiri nace de la religación del hombre a la realidad, ya que el carácter enigmático que ésta presenta plantea el problematismo de la fundamentalidad de lo real, lo cual lleva al hombre a iniciar una búsqueda para precisar en qué consiste esta realidad fundamento hacia la que está lanzado. La religación es la vía de acceso del hombre a Dios. El hombre encuentra a Dios no reflexionando sobre el mundo exterior ni sobre sus fenómenos mentales, sino haciéndose persona. En esta búsqueda de Dios como realidad-fundamento el hombre parte de una cierta idea de Dios que puede sintetizarse en tres puntos. En primer lugar, Dios tiene que ser el fundamento del poder de lo real. Segundo, este Dios tiene que ser una realidad suprema y no un ente supremo. Y finalmente, tiene que ser una realidad absolutamente absoluta. Así, el hombre en la plenitud de su ser se encuentra religado a Dios como su máxima posibilidad, porque es la posibilidad que le hace ser él mismo. El camino para llegar a ser personas responsables y libres, es el camino de la religación donde Dios se presenta como experiencia del hombre y el hombre se vive como experiencia de Dios.