La dégradation des forêts est lune des causes du changement climatique. Vu limportance des forêts de mangroves sur les services écosystémiques rendus et linsuffisance dinformations sur la capacité de stockage du carbone de ces écosystèmes en Côte dIvoire, lobjectif de cette étude a été de combler ses lacunes dinformations. Les résultats ont permis de montrer que ces mangroves lagunaires sont exposées aux plantes envahissantes telles que, Eichornia crassipes, Pitia stratiotes, Nymphaea lotus et Acrostichum aureum. En effet, lévaluation du stock de carbone dans les mangroves dAnna, caractérisées par lhabitat côtier, équivaut à 12,33 ± 15,21 tC / ha. A Eloka-To, les mangroves enregistrent un stock de carbone de lordre de 32,69 ± 39,46 tC / ha. Ces résultats comparés à dautres écosystèmes montrent une faible capacité de stockage des mangroves étudiées à celle des grands écosystèmes de mangroves non perturbés. Ainsi, il devient urgent de prendre des mesures pour la sauvegarde des mangroves ivoiriennes.